DUO verleent diensten aan het primair onderwijs, het voortgezet onderwijs, het beroepsonderwijs en het hoger onderwijs. Maar ook gemeenten en andere overheidsinstanties maken gebruik van onze gegevens en diensten.

DUO beheert per onderwijsvolgende de onderwijsgegevens in het Basisregister Onderwijs (BRON). Deze gegevens worden gebruikt voor de bekostiging van de onderwijsinstellingen en voor beleidsinformatie. BRON maakt hierbij gebruik van het Onderwijsnummer, of eigenlijk het persoonsgebonden nummer, dit is in principe gelijk aan het burgerservicenummer (BSN). 
De invoering van BRON heeft onder meer gevolgen voor de administratie van onderwijsinstellingen en voor de gegevensuitwisseling tussen de onderwijsinstellingen en DUO. Het doel hiervan is om op termijn de administratieve last van scholen te verlichten. Scholen hoeven hun gegevens aan steeds minder partijen door te leveren, omdat DUO deze gegevens verstrekt. Een bijkomend voordeel is dat de betrouwbaarheid en veiligheid van gegevens toenemen. Het ministerie van OCW wil met deze gegevens meer controle krijgen op de rechtmatigheid van de bekostiging. En tot slot leveren de gegevens in BRON  waardevolle managementinformatie voor o.a. ministerie en onderwijsinstellingen.

Helpdesk IPO ondersteunt onderwijsinstellingen, gemeenten en overige instanties. IPO geeft antwoord op inhoudelijke vragen over de elektronische gegevensuitwisseling tussen DUO en haar klanten. IPO werkt voor de sectoren VO, BVE en HO. Het Primair onderwijs heeft een gespecialiseerde ‘eigen’ helpdesk.

Relatiebeheerders onderhouden contact met onderwijsinstellingen, gemeenten, opdrachtgevers en de maatschappelijke omgeving. De afdeling Klantrelatie organiseert klanttevredenheidsonderzoeken, klachtenregelingen, klantenpanels, symposia en conferenties, maar initieert ook brancheoverleggen, netwerkbijeenkomsten en adviesgroepen.

DUO beheert een digitaal verzuimloket waarmee onderwijsinstellingen op een uniforme wijze hun verzuimmeldingen kunnen doorgeven aan verzuimmedewerkers van gemeenten. Het verzuimloket kan ook worden gebruikt om contact tussen melder en behandelaar tot stand te brengen. Het doel is om schooluitval terug te dringen en het behalen van een startkwalificatie te bewaken.